تتألف إدارة المعهد من مدير عام ومن خبراء وموظفين فنيين وإداريين لازمين للعمل على تنفيذ أهداف المعهد وفقاً للهيكل التنظيمي.
يعين المدير العام من قبل مجلس الأمناء لولاية مدتها أربع سنوات، ويحق للمجلس عند الضرورة تمديد ولايته وفق ما يراه مناسباً لفترة أقصاها سنتان. يكون المدير العام متفرغاً لأعماله وهو المشرف التنفيذي على كافة النواحي العلمية والإدارية والمالية، ومنها ما الأتي: